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结合笔者等多年积累的经验详细介绍环境微生物学研究中变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术应用全步骤:从环境样品中直接提取总DNA,利用5′端含GC夹子的引物PCR 16S rDNA的部分片段,将PCR产物在含有浓度线形递增的变性剂的聚丙烯酰胺凝胶中进行电泳分析,使不同来源的DNA片段在电泳胶中分离,从胶中切出分离的DNA片段测定碱基序列,进行分类分析。PCR-DGGE技术能够检测不可培养的微生物基因,而DGGE技术与克隆等其他技术结合更能发挥其分离作用。 |
关键词: 环境微生物,变性梯度凝胶电泳,聚合酶链式反应,方法详解,酒精沉淀法,细菌 |
DOI:10.11841/j.issn.1007-4333.2006.05.111 |
投稿时间:2006-05-09 |
基金项目:国家自然科学基金资助项目(30571088) |
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Protocols of applification of denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) in studies of environmental microorganism |
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Key words: environmental microorganism,denaturing gradient gel electrophoresis(DGGE),PCR,protocol,ethanol precipitation methods,bacteria |